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労務が行う年末調整の手順と注意点を解説！効率化とシステム活用とは？

記事更新日: 2026/03/09

執筆: 編集部

労務の重要な役割の一つに年末調整があります。

年末調整は適切な手順と注意点を理解しておくことが大切です。

この記事では、労務が行う年末調整の業務を改めて理解し、それを効率化するシステム活用についても理解していきましょう。

1.
労務管理と年末調整
- 年末調整の目的
- 年末調整をしないと発生する罰則
2.
労務の年末調整｜準備から提出まで
- 10月
- 11月
- 12月
- 1月
3.
年末調整は毎年改正があるので注意する
4.
おすすめの年末調整システム3選
5.
まとめ

労務管理と年末調整

年末調整の目的

年末調整の目的は「本来支払うべき所得税」と「源泉徴収した金額」とを合わせることです。

源泉徴収は見込みで税金を天引きしますので、最終的な金額と年末調整で合わせるのです。

なお、年末調整は「税金が還元される仕組み」と考えている人が多いかもしれませんが、税金を支払う場合もあります。

最終的な金額に天引き金額が達していなければ、年末調整でそれが徴収されるのです。

年末調整をしないと発生する罰則

年末調整は雇用主の義務です。

そのため年末調整をしなければ、その雇用主には罰則が適用されます。

具体的には年末調整に関わる法律で定められており、年末調整をしないと「10年以下の懲役、もしくは200万円以下の罰金もしくはその両方」の罰則を受けてしまいます。

勤務先で年末調整に対応してもらえない場合は、管轄する税務署に相談をしましょう。

対象者であるにも関わらず年末調整をしてもらえていない場合は、税務署からその企業に指導が入ります。

労務の年末調整｜準備から提出まで

10月

今年度の年末調整の確認

担当者は全社的に年末調整の案内をします。

ただ、年末調整の内容は毎年変更がありますので、先に変更内容の確認が必要です。

税務署の公式サイトに案内が出ていますので、担当者であれば目を通しておきましょう。

また、変更があるとそれを踏まえて社内案内などを作成する必要があります。

毎年使いまわしている場合は、変更点を確認し修正するようにしましょう。

内容によっては専門家のアドバイスをもらったほうが良い可能性も考えられますので、はやく確認するに越したことはありません。

従業員への書類配布・案内

年末調整の配布は、紙に印刷して配布をする場合もあれば、データで配布をして各自印刷してもらう場合もあるでしょう。

なお、説明会などを実施するのであれば、このタイミングで日程の案内をしましょう。

特に年末調整を簡略化するために「年末調整システム」「マイナポータルとの連携」「国の年末調整支援ソフトウェア」などを導入する場合は説明会を開くようにしましょう。

これらは事前準備などが必要ですので、口頭で説明したほうが良い内容です。

特段説明会などを開催しない場合は、具体的にやるべきことが分かるマニュアルなどを作成するのが理想的です。

11月

従業員への提出期限の案内と質問回答

従業員の人数や労務の負荷状況を確認し、年末調整の期限日を設けましょう。

生命保険料小規模企業共済など控除に必要な書類を従業員が取り寄せなければならない場合があります。

そのため、あまりに短い期間は設定しないようにしましょう。

スケジュールを案内する際には、よくある質問とその回答を展開しておくと良いでしょう。

年末調整に関連する書類を展開すると、様々な質問が来るものです。

質問事項が早くに集まっている場合は「第一弾」「第二弾」などと段階的に展開する方法もあります。

なるべく早く展開しておくことで、同様の質問件数を減らせます。

書類回収

質問も収まり従業員が対応できれば、回収を進めましょう。

まとめて対応すると時間がかかりますので、回収したものから内容チェックなどを進めます。

他の書類と混ざってしまうと、重要な書類を見落とす可能性があります。

専用の受け取り口などを用意して、郵便物として分けてもらうのが理想的です。

12月

集計作業

年末調整で回収した書類をもとに、労務で集計作業を行います。

様々な控除の適用などが判明し、所得税が変更になる人も多いでしょう。

場合によっては集計の過程で書類不足が判明することがあります。

そのような時は、なるべく早く従業員に連絡をしましょう。

1月

各所へ書類提出

1月30日までに年末調整に関連する書類の提出が必要です。

管轄の税務署に所得税と書類を提出し、自治体へ給与支払報告書を提出します。

なお、自治体への提出は従業員が住んでいる市町村へそれぞれ提出します。

居住地域が多ければ多いほど手間がかかりますので、年末調整だけではなく書類提出のことも考慮しておきましょう。

年末調整は毎年改正があるので注意する

年末調整に関連する法律は毎年改正されます。

そのため、必ず法律がどのように改正されたかを確認しましょう。

確認する法律は多岐にわたりますので、専門家などのアドバイスを踏まえるのが一番です。

例えば2020年は、新型コロナウイルスの影響もあり多くの法律が改正されたり新設されたりしています。

例を挙げると以下のとおりです。

2020年年末調整：主な変更点

給与所得控除と基礎控除の変更
ひとり親控除の新設
世帯合計収入金額の見直し
住宅ローン控除の変更

これらは一例ですが2020年は法律が大きく変化しています。

税務署のホームページなどで変更内容をよく確認しておきましょう。

2020年の年末調整は変更点が多い！変更箇所を図表で解説！

「2020年の年末調整は変更点が多くて分かりづらい」と悩んでいる企業担当者向けに、年末調整の変更点や手順をまとめた記事です。2020年から開始される変更点の一つでもある年末調整の電子化についても紹介しているので検討している方は参考にしてみてください。

おすすめの年末調整システム3選

年末調整は従業員一人ずつ行う必要があり、申告書を作成するためには時間と労力がかかります。

年末調整システムを導入すれば、事務作業の効率化につながり、人件費の削減も可能となります。

ここでは、厳選した年末調整システムを詳しく紹介します。導入する際に参考にしてみてください。

	初期費用	月額費用	無料お試し	機能
オフィスステーション	11万円	46円/人	30日間	操作が簡単
マネーフォワードクラウド年末調整	0円	基本料金2,980円～+100円(6名以上)	1ヶ月	充実したサポート体制
ジョブカン労務HR	0円	有料プラン400円～/人	30日間	低コストで使いやすい

操作が簡単で顧客満足度が高い！『オフィスステーション』

画像出典元：「オフィスステーション」公式HP

特徴

オフィスステーションは、労務手続き・年末調整・給与明細・勤怠・有休管理など、人事労務のあらゆる業務を効率化するクラウド型人事労務システムです。

必要な機能だけを選べる柔軟性と、全業務をシームレスにつなぐ「統合型（ポータル）」としてのデータ連携力を兼ね備えています。

6年連続でシェアNo.1※を獲得し、導入社数は55,000社以上※※、継続利用率は99.6%と極めて高い満足度を誇る業界屈指のサービスです。

※デロイトトーマツミック経済研究所株式会社「HRTechクラウド市場の実態と展望 2025年度版」より
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機能

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・催促メール一括送信
・変更の差分データの自動表示機能
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・専門家によるサポート

オフィスステーションの料金体系は、「製品ごとの月額利用料」と初回契約時の「登録料110,000円（税込）」で構成されています。

また、すべての製品を無料トライアルで30日間試すことができ、トライアル期間中に登録したデータは、本契約へ移行する際にそのまま引き継ぐことができます。
※「オフィスステーション Pro」のみ、無料トライアル期間は14日間

	製品利用料 (従業員1名あたり)	最低利用金額
オフィスステーション労務	440円	4,400円 (従業員数が10名以下の場合、一律)
オフィスステーションタレントマネジメント	550円	5,500円 (従業員数が10名以下の場合、一律)
オフィスステーション年末調整	46円	11,000円 (従業員数が20名以下の場合、一律)
オフィスステーション勤怠	330円	3,300円 (従業員数が10名以下の場合、一律)
オフィスステーション給与	440円	4,400円 (従業員数が10名以下の場合、一律)
オフィスステーション給与明細	33円～	1,100円 (従業員数が20名以下の場合、一律)
オフィスステーション有休管理	110円～	1,100円 (従業員数が10名以下の場合、一律)
オフィスステーションマイナンバー	33円～	3,300円 (従業員数が100名以下の場合、一律)

※税込

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オフィスステーションとは？評判・料金を解説！

この記事では、オフィスステーションの評判や口コミ・特徴・料金を紹介していきます！

クラウドで紙のいらない年末調整！『マネーフォワードクラウド年末調整』

画像出典元：「マネーフォワードクラウド年末調整」公式HP

特徴

マネーフォワードクラウド年末調整は、web上での書類配布、入力・回収・進捗確認・差戻、提出（e-Tax、eLTAX 連携による電子手続）に対応しており、従業員も労務担当者も煩雑になりがちで面倒な年末調整業務が、Web上でかんたんに行うことが可能です。

また既存の給与計算ソフトはそのままに、年末調整部分だけクラウド化（電子化）することもでき、大変便利なサービスです。

機能

＜年末調整機能の詳細＞

・従業員情報登録
・年末調整計算の対象者を一元管理
・従業員情報の更新状況を一元管理
・年末調整計算の進捗状況を一元管理
・年末調整の精算月を選択可能
・給与等総額の自動集計
・各種控除額の自動計算
・年末調整の自動計算
・給与所得者の扶養控除等（異動）申告書出力
・給与所得者の保険料控除申告書出力
・源泉徴収簿出力