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記事更新日: 2025/06/27
労務管理システムにはクラウド型とパッケージ型がありますが、高いセキュリティやカスタマイズ性を求める企業にはパッケージ型が最適です。
本記事では、厳選したおすすめのパッケージ型労務管理システム8選を紹介します。
システムの選び方や導入に向いている企業の特徴、導入時の注意点、クラウド型との違いまで詳しく解説しているので、選定の参考にしてみてください。
このページの目次
労務管理システムとは、従業員の勤怠管理や給与計算など、労務管理業務全般を効率化するツールです。
社会保険手続きや年末調整の管理などにも対応し、労働法令の遵守を支援します。
パッケージ型（買い切り）は、システムを一度購入し、自社のサーバーやPCへインストールして利用する形式です。
月額費用がかかるクラウド型とは異なり、導入時にまとまった費用を支払うことで、基本的にその後は追加費用なしで、永続的に利用できます。
特に、中小企業や特定の業界（製造業、建設業など）で広く採用されており、カスタマイズ性やセキュリティを重視する企業に最適です。
パッケージ型労務管理システムには、日々の業務を効率化する多彩な機能が搭載されています。
以下は、労務管理システムの主な機能です。
従業員の出勤・退勤時間、残業時間、休暇（有給休暇、特別休暇など）の取得状況を記録・集計する機能です。
多くのシステムでは、タイムカード・ICカード・PCログイン情報との連携が可能です。
労働時間の自動計算や異常値（遅刻・早退・過剰残業）のアラート機能も備えています。
労働基準法に基づく労働時間管理が容易になり、過重労働の防止やコンプライアンス強化に有効です。
基本給から各種手当、控除項目までを含む、複雑な給与計算を自動化する機能です。
最新の税率や保険料率を反映し、銀行振込用データの出力にも対応可能。
従業員ごとの給与情報や控除項目を一元管理でき、計算ミスを削減します。
パッケージ型では、企業特有の手当や給与体系に応じた柔軟なカスタマイズが可能な点も特徴です。
健康保険・厚生年金保険・雇用保険・労災保険などの各種手続きを効率化する機能です。
入社時の資格取得届や退社時の資格喪失届の作成、月額変更届、算定基礎届などの定期手続きも自動化できます。
電子申請（e-Gov）に対応したシステムでは、作成した届出書類のオンライン提出が可能です。
紙ベースの書類管理をデジタル化することで、事務負担を軽減します。
年末調整に必要なデータ入力や計算、源泉徴収票の発行を自動化します。
従業員から提出される各種控除申告書の内容を入力することで、税額の計算や還付・徴収額の算出が可能です。
生命保険料控除や住宅借入金等特別控除など、複雑な控除項目にも対応しています。
労働基準法、税法、社会保険関連法規など、労務管理に関わる法令遵守をサポートする機能です。
たとえば、年5日の有給休暇取得義務へのアラート表示や、時間外労働の上限超過に関する警告、36協定に基づく労働時間の管理などがあります。
一部のシステムでは、最新の法改正情報を自動反映するアップデート機能があり、最新ルールを把握していなくても運用が可能です。
従業員の基本情報から人事評価、キャリア履歴まで、幅広い人材情報を一元管理する機能です。
組織図の作成・更新、部署異動や昇進・降格の履歴管理、スキルや資格の管理が行えます。
検索やフィルタリング機能により、必要な情報のスムーズな排出も可能です。
パッケージ型では、自社サーバーでデータを管理するため、機密性の高い情報も安全に保管できます。
勤怠状況、残業時間、有給休暇の取得状況、離職率、給与推移など、労務関連データを集計・可視化する機能です。
グラフや表形式での出力が可能で、部署別や期間別などの条件を指定して分析できます。
ExcelやCSV形式でのデータエクスポートに対応しているシステムが多く、外部ツールとの連携も容易です。
従業員とその扶養家族のマイナンバーを安全に管理する機能です。
個人番号の収集から利用、廃棄まで、マイナンバー法に準拠した適切な取り扱いを支援します。
社会保険手続きや税務手続きでマイナンバーが必要な際には、自動で該当番号を取得・入力することが可能です。
パッケージ型とは、ソフトウェアを購入し、企業のサーバーやパソコンにインストールして利用する形態を指します。
初期費用は高額ですが、導入後のランニングコストが抑えられる点や、カスタマイズの柔軟性が強みです。
この形態は、長期的なコストを抑えたい企業や、データ管理を自社内で完結させたい企業に適しています。
クラウド型とは、インターネット経由でベンダーが提供するサービスを利用する形態です。
初期コストが低く、常に最新の状態で使える点が強みで、場所を選ばずに利用できるため、業務環境の変化が多い企業に適しています。
パッケージ型とクラウド型の主な違いは、以下のとおりです。
| 項目 | パッケージ型 | クラウド型 |
| 運用方法 | 自社のPCやサーバーにソフトをインストール | インターネット経由でサービスにアクセス |
| 費用形態 | 初期費用（買い切り） | 月額・年額などの定額課金 |
| カスタマイズ | 自社の業務に合わせて柔軟にカスタマイズ可能 | 標準機能が中心で、カスタマイズは限定的 |
| セキュリティ | 自社内で管理するため、物理的な制御がしやすい | 提供業者のクラウドサーバーに依存 |
| 更新・保守 | 法改正対応はアップデートやパッチ適用で対応。手動管理が必要な場合あり | 法改正や新機能が自動アップデート。常に最新状態で利用可能 |
| 利用環境 | 基本的にインストールした端末に限定される | 複数端末・外出先でも利用可能 |
パッケージ型労務管理システムの導入が特に効果的な企業の特徴について、4つの観点から詳しく解説します。
医療機関・金融機関・防衛産業・自治体関連など機密データを扱う業界では、自社サーバーでデータ管理のできるパッケージ型が適しています。
外部にデータを預けることに対して不安や規制がある場合でも、パッケージ型であれば物理的なアクセス制御や社内ポリシーに基づいた運用が可能です。
なお、自社でのセキュリティ管理には、一定のITリソースや専門知識が必要となります。
独自の給与体系やシフトパターン、帳票フォーマットを持つ企業では、業務フローに合わせた柔軟なシステム設定が求められます。
パッケージ型は、企業ごとのニーズに応じたカスタマイズができるほか、特定の業界向けモジュールや独自のレポート作成機能の追加も可能です。
クラウド型に比べて柔軟性が高い一方で、カスタマイズには初期設定の手間やベンダーとの連携が必要となります。
インターネット環境が不安定な地域や、セキュリティポリシーなどにより外部接続が制限されている企業では、パッケージ型が適しています。
自社サーバーやPCで動作するため、ネットワーク接続に依存せず、勤怠データや給与計算を安定的に処理することが可能です。
なお、複数拠点でのデータ共有には別途設定が必要で、リアルタイム同期を求める場合はクラウド型が有利な場合もあります。
初期費用は高額ですが、月額・年額のサブスクリプション費用が発生しないため、数年単位で見た場合のコストパフォーマンスに優れています。
特に利用人数が多い企業や、システムを長期間運用する前提の企業にとっては、クラウド型よりもトータルコストが抑えられるケースが多いです。
初期費用とは別に、保守契約やアップデート費用も予算に含めて検討する必要があります。
ツール名
主な機能
無料トライアル
サポート体制
導入実績数
BIZWORK+
TimePro-NX
勤怠管理 EX
desknet's NEO
クロノスPerformance
Roco Time
画像出典元：「BIZWORK+」公式HP
「BIZWORK+」は、ニーズシェア株式会社が提供する、コストパフォーマンスに優れたパッケージ型の労務管理システムです。
給与計算の効率化に加え、未払い残業代の請求対策や労務費の適正化管理を支援。
コンプライアンスや従業員の健康管理機能を標準搭載しているほか、企業ごとの運用に合わせた柔軟なカスタマイズも可能です。
| おすすめポイント | 法改正に伴う機能アップデートを迅速に提供し、常に最新の法定規制に準拠した運用ができる |
| 主な機能 |
|
| サポート体制 | 導入から運用後まで手厚いサポート |
| 導入実績数 | 具体的な導入実績数は公表されていない |
| 無料トライアル | 30日間 |
| 基本パッケージ 専用タイムレコーダー付 |
給与システム連携機能 | サーバー初期設定 | |
| パッケージ費用 | 750,000円 | 300,000円～ | 300,000円～ |
（税抜）
※初期導入支援費用（約半年）1,500,000円（税別）～ （規模や運用の複雑さにより変動）
画像出典元：「TimePro-NX」公式HP
「TimePro-NX」は、人事システムを基盤に、就業・給与・セキュリティ機能を自由に組み合わせられる統合型人事労務管理システムです。
柔軟なシステム設定により、各企業の働き方に合わせたストレスフリーな運用を実現します。
労務リスクの排除と業務効率化を両立できる設計が強みです。
| おすすめポイント | 勤怠・給与・人事データを一つのシステムでシームレスに連携し、データの一元管理による業務効率の大幅な向上を実現 |
| 主な機能 |
|
| サポート体制 | 導入から運用後まで手厚いサポート |
| 導入実績数 | 20,000社以上（サービス累計） |
| 無料トライアル | デモあり |
詳細については、お問い合わせが必要です。
画像出典元：「勤怠管理 EX」公式HP
「勤怠管理 EX」は、テレワークや在宅勤務の最適化を支援するリモートワーク勤怠管理システムです。
勤怠管理に加え、スケジュールや会議室予約、メッセンジャー機能を統合し、テレワークの効率化を実現。
PC・ICカード・モバイルでの柔軟な打刻や経費精算、文書管理にも対応し、多様な働き方を支援します。
| おすすめポイント | Excelベースのワークフローと連携可能。既存の申請書をそのままシステム化し、運用変更の手間を最小限に抑えられる |
| 主な機能 |
|
| サポート体制 | 導入から運用後まで手厚いサポート |
| 導入実績数 | 具体的な導入実績数は公表されていない |
| 無料トライアル | デモあり |
詳細については、お問い合わせが必要です。
画像出典元：「desknet's NEO」公式HP
「desknet's NEO」は、組織内の情報共有を円滑にし、業務効率化を促進する国産グループウェアです。
ノーコードツールで自社に合わせた業務アプリを無制限に増やせる点が特徴。
労務管理単体のシステムではありませんが、自社専用の業務アプリをつくることで、勤怠管理や給与計算を効率化できます。
中小企業から官公庁まで、あらゆる規模・業種で利用でき、自社に合わせた業務課題を解決します。
| おすすめポイント | アプリ作成ツール「AppSuite」により、紙やExcelの申請書から複雑な業務処理まで自社専用の業務アプリが作れる |
| 主な機能 |
|
| サポート体制 | 24時間365日のサポート |
| 導入実績数 | 累計528万ユーザー以上／1,100団体以上 |
| 無料トライアル | 30日間 |
| 基本ライセンス価格 | 年間サポート価格（2年目以降/年） | ||
| ユーザー数 | 価格 | ユーザー数 | 価格 |
| 5ユーザー | 75,000円 | 20ユーザーまで | 18,000円/年 |
| 10ユーザー | 100,000円 | ||
| 20ユーザー | 150,000円 | ||
| 30ユーザー | 200,000円 | 50ユーザーまで | 45.000円/年 |
| 50ユーザー | 250,000円 | ||
| ユーザー数により変動あり、詳しくは公式HPでご確認ください。 | |||
| 無制限 | 15,340,000円 | 無制限 | 2,340,000円/年 |
（税抜）
| 追加ライセンス価格 （1,000ユーザーまで） |
追加ライセンス価格 （1,001ユーザー以上） |
||
| ユーザー数 | 価格 | ユーザー数 | 価格 |
| 5ユーザー追加 | 25.000円 | 1,000～1,500ユーザー | 550,000円 |
| 10ユーザー追加 | 50,000円 | 1,500～2,000ユーザー | 590,000円 |
| 20ユーザー追加 | 100,000円 | 2,000～3,000ユーザー | 1,180,000円 |
（税抜）
※ユーザー数により変動あり
画像出典元：「クロノスPerformance」公式HP
「クロノスPerformance」は、複雑な勤務形態にも柔軟に対応する労務管理システムです。
勤務時間の自動集計をはじめ、変形労働制への対応や有給管理など、個別カスタマイズを行うことなく精度の高い集計を実現。
既存の給与ソフトとの連携により、データの転記作業を効率化し業務負担を軽減します。
| おすすめポイント | カスタマイズ性が高く、業種や企業規模を問わず、独自の就業ルールに合わせた設定ができる柔軟性 |
| 主な機能 |
|
| サポート体制 | 導入から運用後まで手厚いサポート |
| 導入実績数 | 300万人以上（利用アカウント） |
| 無料トライアル | デモあり |
| 50人制限 | 100人制限 | 300人制限 | |
| スタンドアロン | 369,600円 | 435,600円 | 580,800円 |
| ネットワーク 2クライアント |
580,800円 | 805,200円 | |
| ネットワーク 3クライアント |
739,200円 | 1,029,600円 | |
| ネットワーク 5クライアント |
884,400円 | 1,254,000円 | |
| ネットワーク 10クライアント |
1,029,600円 | 1,478,400円 | |
| ネットワーク 15クライアント |
1,174,800円 | 1,689,600円 | |
| ネットワーク 20クライアント |
1,320,000円 | 1,914,000円 |
（税込）
※従業員数や利用クライアント数によって、料金体系が変動します。
画像出典元：「Roco Time」公式HP
「Roco Time」は、業種・業界や社員数の規模を問わず、複雑な就業規則にも対応可能な高機能勤怠管理システムです。
シンプルで直感的な操作性と複数のシステム連携機能により、ワークフローの一元効率化を実現。
日本語・英語のバイリンガル対応で、多国籍企業にもスムーズに導入できます。
| おすすめポイント | 約500ものパラメータを独自に設定でき、企業の複雑な就業規則や雇用形態にも柔軟に対応することが可能 |
| 主な機能 |
|
| サポート体制 | 導入から運用後まで手厚いサポート |
| 導入実績数 | 具体的な導入実績数は公表されていない |
| 無料トライアル | なし |
詳細については、お問い合わせが必要です。
画像出典元：「Tomas」公式HP
「Tomas」は、柔軟なカスタマイズで多様な労働形態に対応する、使いやすさにこだわった高機能なパッケージ型勤怠管理システムです。
リアルタイムな勤怠データ管理で、給与計算の効率化を実現。
1年単位の変形労働制や短時間勤務など複雑な就業規則も、まとめて管理できます。
| おすすめポイント | 企業の勤務形態・業種業態に合わせた柔軟な設定変更やカスタマイズが可能 |
| 主な機能 |
|
| サポート体制 | 電話・メールにて導入から運用まで対応 |
| 導入実績数 | 70社以上 |
| 無料トライアル | なし |
詳細については、お問い合わせが必要です。
画像出典元：「タイムワークス」公式HP
「タイムワークス」は、多様な業界・業種の就業規則に柔軟に対応する包括的なパッケージ型労務管理システムです。
同一企業内において、部門ごとに異なる就業ルールや勤務体系も、まとめて管理できます。
オンプレミス型とクラウド型の両方から選択でき、働き方改革関連法への対応も万全です。
| おすすめポイント | 独自のアラート機能「労務管理オブザーバー®」と「働き方アドバイザー®」により、法令違反のリスクを事前に察知。具体的な改善アドバイスまで自動提供 |
| 主な機能 |
|
| サポート体制 | 具体的なサポート範囲は要確認 |
| 導入実績数 | 約2,100社 |
| 無料トライアル | なし |
詳細については、お問い合わせが必要です。
自社の要件に合わせて柔軟にカスタマイズできるというメリットがある一方で、導入には慎重な検討が必要です。
以下に、導入時に注意すべき5つのポイントを解説します。
自社用にカスタマイズしたり、サーバーにインストールしたりするケースが多く、導入時に多額の初期投資が必要になる傾向があります。
システム本体に加え、要件定義・設計・開発・インフラ構築などが加算されるため、トータルで数百万円〜数千万円に及ぶケースも少なくありません。
予算計画を立てる際は、導入後の保守・運用コストも含め、総合的に検討する必要があります。
自社の業務フローに合わせたカスタマイズが可能な反面、その分導入までのプロセスが長期化しやすい傾向があります。
要件定義や設計段階での認識のズレが生じた場合、修正や再調整が必要となり、さらに時間がかかる可能性もあります。
スムーズに導入を進めるためには、社内の関係部署との連携や、ベンダーとの密なコミュニケーションが重要です。
パッケージ型の場合、クラウド型のように自動更新されないため、法改正への対応が遅れるリスクがあります。
対応が遅れると、法令違反や業務トラブルにつながるリスクがあるため、法改正への対応体制も含めて確認しておきましょう。
システム導入後の運用・保守を社内で行うことが前提となるため、保守やトラブル対応には、一定のITスキルを持った人材が必要です。
バグ対応、ログ管理、セキュリティ対策、OS・ミドルウェアの更新など、日常的なメンテナンスが欠かせません。
情報システム部門のない企業では、IT人材の確保が大きな課題になることがあります。
パッケージ型システムは、基本的に自動でアップデートされることはありません。
時間が経つにつれ、操作性やUIが古くなったり、新しい機能に対応できなくなったりなど、いわゆる“時代遅れ感”が出てくる可能性があります。
そのため、将来のアップデートに備えて、保守契約の内容や更新ポリシーを導入前にしっかり確認しておくことが大切です。
労務管理システムを選ぶ際、クラウド型とパッケージ型のどちらが自社に適しているか迷うことがあります。
それぞれにメリット・デメリットがあるため、以下の3つの観点から比較し、自社にとって最適な選択を見極めることが大切です。
クラウド型は初期費用が比較的低く、月額課金で使い始められる点が魅力ですが、長期間利用するとトータルコストが高くなる可能性もあります。
一方でパッケージ型は、初期投資が大きいものの、月額費用が発生しない（保守費用のみ）ため、数年単位で見るとコストメリットが出るケースも少なくありません。
－判断ポイント
自社にとって、どちらが費用対効果に優れているかを見極めるには、導入から5年、10年といった中長期視点でのコスト試算が重要です。
クラウド型は標準機能が充実しているほか、定期的な自動アップデートで最新機能が追加されるため、拡張性が高いといえます。
しかしながら、ベンダーが提供する機能に依存するため、独自の業務フローに合わせたカスタマイズが難しいケースが多いです。
一方でパッケージ型は、自社サーバーで運用するためカスタマイズの自由度が高く、特定のニーズに合わせて柔軟に設定できます。
けれども、機能追加やシステム拡張には追加開発が必要となるため、時間とコストがかかる点に注意が必要です。
－判断ポイント
現在の業務だけでなく、将来的な事業展開や業務拡張を見据えて、どの程度システムに柔軟性を求めるかを基準に選びましょう。
クラウド型とパッケージ型の「いいとこ取り」をしたハイブリッド型も存在します。
たとえば、基幹業務は自社サーバーのパッケージ型で運用し、給与計算や勤怠管理など一部機能をクラウド型で利用するといった柔軟な構成が可能です。
これにより、カスタマイズ性やセキュリティを確保しつつ、クラウドの利便性（自動アップデートやリモートアクセスなど）を活用できます。
－判断ポイント
柔軟な構成が可能な一方で、システムの統合・連携や運用管理が複雑になることもあるため、社内に十分なIT体制があるかどうかも含めて検討しましょう。
パッケージ型労務管理システムは、セキュリティやカスタマイズ性を重視する企業に適しています。
初期費用や導入期間、法改正対応などの課題を踏まえつつ、クラウド型との違いを理解し、自社に最適なシステムを選ぶことが重要です。
長期的な視点でコストや運用体制を検討し、ハイブリッド型も視野に入れながら最適なシステムを選定しましょう。
画像出典元：O-dan
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